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人体肠道微生态系统是一个复杂的微生态系统，肠道菌群包含种以上的微生物，重量甚至和人体肝脏接近，约1.5kg，包括细菌、真菌和古生菌等[1]。肠道菌群的生理功能包括营养作用、代谢作用、生物拮抗和免疫刺激等，肠道菌群紊乱会使机体适应性免疫及固有免疫受损，增加感染性疾病的发生风险。肠道真菌对维持肠道微生态平衡有着重要的作用[2]。目前，关于肠道细菌与人类健康与疾病之间的关系已有大量研究报道，然而对肠道真菌的研究远不及细菌，现将已发现的肠道真菌及其对人体健康的影响，以及肠道真菌的主要研究方法进行综述。

肠道微生物群可分为两种不同的生态系统：肠腔微生物群（主要存在于粪便中）和黏膜微生物群（与黏膜结合并黏附于肠上皮细胞），通常可从肠道和粪便中分离得到[3]。迄今为止，已经在属于子囊菌门（As